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基因組是從腳趾指甲到眉毛的所有身體部位的總體規(guī)劃。但是,決定構建內(nèi)容的不僅僅是藍圖。從藍圖中提取指令的所有蜂窩式播放器都將自己的解釋添加到設計中,而研究人員仍在發(fā)現(xiàn)新的播放器。托馬斯·杰斐遜大學的研究人員使用他們開發(fā)的新工具,在細胞中發(fā)現(xiàn)了一種新的RNA分子亞型,證據(jù)表明它們可能在衰老過程中起作用。
“很多研究都集中在最著名的短RNA上,即microRNA,”資深作者Yohei Kirino博士說,他是杰斐遜計算醫(yī)學中心生物化學與分子生物學系副教授。“ MicroRNA的強大之處在于它可以使信使RNA沉默,從本質(zhì)上轉(zhuǎn)移了基因組編碼的某些細胞元件的產(chǎn)生,我們可以通過既定方法對其進行研究。我們想知道其他更難捕獲的短RNA在做什么?我們的研究開始回答這個問題。”
Kirino博士研究的RNA亞型稱為含環(huán)狀磷酸的RNA,簡稱cP-RNA。盡管研究人員知道這種異常形式的磷酸鹽存在于RNA分子上,但他們認為這只是RNA消化過程中產(chǎn)生的一種中間形式。通過擴增和測序分子來追蹤RNA的當前方法無法捕獲具有環(huán)狀磷酸酯尾巴的RNA。“形狀是有問題的,”基里諾博士說。
然而,三年前,基里諾博士的實驗室開發(fā)了一種靶向cP-RNA 的系統(tǒng),以便可以對其進行擴增和測序。使用這種方法,研究團隊能夠?qū)π∈蠼M織中存在的所有cP-RNA進行測序。Kirino博士說:“這是該RNA亞型的第一個完整測序數(shù)據(jù)。”
測序顯示出一些驚喜。首先,Kirino博士實驗室的研究員Megumi Shigematsu第一作者表明,cP-RNA的數(shù)量比預期的多得多。鑒定出許多新穎的cP-RNA物種是由各種類型的細胞RNA產(chǎn)生的,例如轉(zhuǎn)移RNA,信使RNA和核糖體RNA。這表明環(huán)狀磷酸酯可能參與了RNA的功能,并在細胞中發(fā)揮了多種作用。
而且這些cP-RNA非常豐富,例如,核糖體RNA中只有一種cP-RNA的豐富度是細胞中所有microRNA品種總和的300倍。cP-RNA也存在于小鼠身體的整個組織中,包括肺,肌肉,脾臟和胸腺。最后,研究人員發(fā)現(xiàn),隨著時間的推移,cP-RNA的豐度會隨著時間的推移而變化,并且隨著老鼠年齡的增長而減少。
Kirino博士說:“我們對這些分子的疑問仍然比答案多。” “但是,鑒于它們的豐富性,它們在全身各組織中的普及程度以及它們的數(shù)量隨著組織的衰老而變化,我們知道這是一個需要進一步探索的領域。”
Kirino博士的實驗室正在努力探索cP-RNA在哮喘,傳染病和癌癥中的作用。
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