DDN的AI平臺(tái)可幫助遞歸地轉(zhuǎn)變藥物發(fā)現(xiàn)操作

DDN 宣布，其高性能 存儲(chǔ)解決方案 已幫助支持Recursion的更廣泛，更快和更高效的藥物發(fā)現(xiàn)研究和運(yùn)營(yíng) ，該數(shù)字生物學(xué)公司通過(guò)自動(dòng)化，人工智能和機(jī)器學(xué)習(xí)(ML)功能來(lái)發(fā)現(xiàn)新藥。閱讀“ 遞歸”案例研究 ，該 案例描述了基礎(chǔ)架構(gòu)的挑戰(zhàn)，解決方案和優(yōu)勢(shì)，并揭示了鹽湖城正在進(jìn)行的具有全球影響力的工作的細(xì)節(jié)。

在大多數(shù)行業(yè)都在為不斷增加的藥物發(fā)現(xiàn)成本和上市時(shí)間挑戰(zhàn)而戰(zhàn)的情況下，遞歸采用了結(jié)合了科學(xué)技術(shù)方法的新方法。這就需要針對(duì)AI和ML進(jìn)行全面優(yōu)化的高性能藥物發(fā)現(xiàn)處理，旨在從世界上最大的生物圖像庫(kù)中釋放最大的數(shù)據(jù)價(jià)值。

“我們的數(shù)據(jù)是我們的公司，因此我們需要強(qiáng)大的存儲(chǔ)架構(gòu)來(lái)支持AI驅(qū)動(dòng)的模型，” Recursion的首席系統(tǒng)工程師Kris Howard說(shuō)。“管理我們的大規(guī)模數(shù)據(jù)需求需要快速提取，優(yōu)化處理并減少應(yīng)用程序運(yùn)行時(shí)間。”

與DDN的領(lǐng)域?qū)＜液献?，Recursion最初創(chuàng)建了一個(gè)概念證明，其中包含DDN的 EXAScaler ES400NV和ES7990X并行文件系統(tǒng)設(shè)備，這些設(shè)備后來(lái)被擴(kuò)展為2PBs的容量，用于登臺(tái)ML模型。全閃存層被用作充足的旋轉(zhuǎn)磁盤支持的文件系統(tǒng)的前端，每個(gè)文件的前64K存根到該層，然后加速訪問(wèn)數(shù)據(jù)的第一部分，然后將其余部分流式傳輸?shù)叫D(zhuǎn)盤。

使用DDN，Recursion每周執(zhí)行約350,000個(gè)實(shí)驗(yàn)，并針對(duì)數(shù)百種疾病模型篩選數(shù)千種化合物，而現(xiàn)在的成本和時(shí)間僅是傳統(tǒng)藥物發(fā)現(xiàn)方法的一小部分。DDN的混合高性能可擴(kuò)展存儲(chǔ)解決方案針對(duì)AI和ML進(jìn)行了全面優(yōu)化，有助于降低成本并提高生物學(xué)研究的效率。

DDN總裁兼聯(lián)合創(chuàng)始人Paul Bloch說(shuō)：“ DDN作為存儲(chǔ)領(lǐng)導(dǎo)者的聲譽(yù)因我們成熟的解決方案和對(duì)AI數(shù)據(jù)存儲(chǔ)的日益關(guān)注而得到鞏固。” DDN利用智能基礎(chǔ)架構(gòu)來(lái)提供最全面的以數(shù)據(jù)為中心的以AI為中心的解決方案集，DDN靈活調(diào)整Recursion的配置以滿足特定工作負(fù)載的靈活性，帶來(lái)了強(qiáng)大的存儲(chǔ)，可無(wú)縫支持18個(gè)節(jié)點(diǎn)和136個(gè)GPU。作為遞歸的存儲(chǔ)基礎(chǔ)架構(gòu)提供者而受到信任是一項(xiàng)真正的榮譽(yù)，因?yàn)樗麄冎铝τ谄茐膫鹘y(tǒng)的藥物發(fā)現(xiàn)方法并準(zhǔn)確高效地確定疾病的治療方法。”

盡管傳統(tǒng)的存儲(chǔ)架構(gòu)無(wú)法滿足Recursion嚴(yán)格的高性能文件處理要求，但DDN的2PB高性能多層數(shù)據(jù)管理基礎(chǔ)架構(gòu)已幫助最大化GPU計(jì)算資源用于加速的AI工作流程。這種方法不僅為Recursion的苛刻工作負(fù)載提供了極快的性能，而且還有助于緩解文件訪問(wèn)瓶頸，同時(shí)實(shí)現(xiàn)了對(duì)GPU的高效流傳輸。

“我們的DDN存儲(chǔ)非常快，”霍華德說(shuō)。“ Flash層使文件訪問(wèn)時(shí)間減少了40%，我們可以將GPU的利用率提高到100%，并固定在那里。從PFS訓(xùn)練數(shù)據(jù)是非常不尋常的，但這對(duì)于我們的用例來(lái)說(shuō)是一個(gè)完美的解決方案。”