研究人員開發(fā)了可視化斑馬魚基因組中第一個活化基因的工具

在受精后數(shù)小時內(nèi)，由卵子和精子貢獻的染色體形成獨特的基因組。然而，這個新基因組最初是無活性的，必須“喚醒”才能開始其DNA的轉(zhuǎn)錄并開始胚胎發(fā)育。生命的第一步如何發(fā)生長期以來令發(fā)展生物學家著迷。

“從分子的角度來看，這是生命的開始，”弗格斯F.華萊士遺傳學教授，耶魯大學遺傳學系主任安東尼奧·吉拉德斯說。“尚不清楚的是胚胎基因組的轉(zhuǎn)錄活動如何以及什么啟動，以便胚胎開始用自己的基因藍圖控制自身的發(fā)育。”

耶魯大學的Giraldez和他的研究小組發(fā)現(xiàn)，在新形成的基因組中激活DNA需要兩個特定因子，他們在6月17日發(fā)表在“ 發(fā)育細胞 ”雜志上。他們使用顯微鏡和RNA測序分析相結(jié)合，揭示了斑馬魚胚胎細胞核內(nèi)的轉(zhuǎn)錄模式。

研究人員還開發(fā)了可視化斑馬魚基因組中第一個活化基因的工具，稱為miR-430，并追蹤基因在活胚胎中的活性。

“現(xiàn)在我們可以在視覺上查看細胞核內(nèi)部并分析靜音基因組中的第一個基因是如何被喚醒的，”該研究的主要作者和在Giraldez實驗室工作的博士生說。

斑馬魚基因組的激活需要存在由母親產(chǎn)生的兩種蛋白質(zhì)-P300和Brd4-。的破壞活性使用這兩種蛋白質(zhì)的小分子抑制劑阻止胚胎基因組的激活，這反過來又塊胚胎的發(fā)育。然而，研究人員發(fā)現(xiàn)，即使在它們阻斷了這些母體蛋白質(zhì)的產(chǎn)生之后，它們也可以通過人工引入P300和Brd4來克服這種阻滯并過早啟動胚胎基因組的激活。

“這些分子因子起著一種分子計時器的作用，它決定了基因組覺醒的時機，”Giraldez說。“找到參與基因組激活的這些關(guān)鍵因素是我們理解生命開始的關(guān)鍵的第一步。”