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滑鐵盧大學(xué)的研究人員開發(fā)出一種新系統(tǒng),可以顯著加快新藥的發(fā)現(xiàn),減少昂貴且耗時(shí)的實(shí)驗(yàn)室測(cè)試需求。
稱為模式知識(shí)(P2K)的新技術(shù)可以在幾秒鐘內(nèi)預(yù)測(cè)生物序列的結(jié)合,并可能減少藥物研究中的瓶頸。
P2K使用人工智能(AI)來利用數(shù)據(jù)中的深層知識(shí),而不是僅僅依靠經(jīng)典的機(jī)器學(xué)習(xí)。
“P2K是一種游戲規(guī)則改變者,因?yàn)樗軌蚪沂炯m纏在復(fù)雜物理化學(xué)環(huán)境中的細(xì)微蛋白質(zhì)結(jié)合,并且僅基于序列數(shù)據(jù)有力地預(yù)測(cè)相互作用,”系統(tǒng)設(shè)計(jì)工程教授,模式分析和機(jī)器中心創(chuàng)始總監(jiān)Andrew Wong說。情報(bào)(CPAMI)。“從經(jīng)過驗(yàn)證的科學(xué)成果中獲取這些深層知識(shí)的能力將推動(dòng)生物學(xué)研究向前發(fā)展.P2K有能力改變未來數(shù)據(jù)的使用方式。”
雖然已經(jīng)收集了大量的生物序列數(shù)據(jù),但提取有意義和有用的知識(shí)并不容易。P2K算法通過解開多個(gè)關(guān)聯(lián)來識(shí)別和預(yù)測(cè)控制蛋白質(zhì)相互作用的氨基酸結(jié)合來應(yīng)對(duì)這一挑戰(zhàn)。由于P2K比現(xiàn)有的生物序列分析軟件快得多,預(yù)測(cè)準(zhǔn)確度提高了近30%,因此可以大大加快新藥的發(fā)現(xiàn)速度。通過從云中的數(shù)據(jù)庫中提取信息,P2K可以預(yù)測(cè)腫瘤蛋白和潛在的癌癥治療將如何相互作用。
雖然仍處于早期原型階段,黃教授和他的團(tuán)隊(duì)已經(jīng)公開向研究人員提供在線P2K系統(tǒng),以開始識(shí)別新的生物序列相互作用。
“將這種AI技術(shù)交由生物醫(yī)學(xué)研究人員將立即產(chǎn)生結(jié)果,可用于未來的科學(xué)發(fā)現(xiàn),”系統(tǒng)設(shè)計(jì)工程的研究助理,P2K的共同發(fā)明人Antonio Sze-To說。
由于它分析順序數(shù)據(jù),P2K的適用性不僅限于生物醫(yī)學(xué)研究。P2K可以通過預(yù)測(cè)潛在網(wǎng)絡(luò)攻擊的可能性,為智能交易或網(wǎng)絡(luò)安全領(lǐng)域做出有用的聯(lián)想和預(yù)測(cè),從而使金融業(yè)受益。
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